Prof. Dr.-Ing. Josef Pösl - Detailinfo zu Abschlussarbeiten

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OTH Amberg-Weiden

Fakultät Elektrotechnik, Medien und Informatik

Studiengang Software-Systemtechnik

Diplomarbeit

Student: Christoph Dirscherl
Aufgabensteller:Prof. Dr. Nailja Luth 
Durchgeführt in:Firma
Betreuer (Hochschule): Prof. Dr. Nailja Luth , Prof. Dr.-Ing. Josef Pösl 
Abgabedatum:13.4.2007

Thema
Segmentierung von transparenten Zellen

Zusammenfassung
Die Arbeit befasst sich mit der Entwicklung eines Algorithmus zur Segmentierung von transparenten Zellen. Dieser Algorithmus stellt den ersten Schritt zur Verfolgung von dendritischen Zellen auf Video-Mikroskopie-Aufnahmen dar. Unter der Segmentierung ist hier die Konturfindung von dendritischen Zellen in Phasenkontrast-Mikroskopieaufnahmen zu verstehen. Neben der Entwicklung der Lösung wird auf die biologischen Grundlagen und das Phasenkontrastverfahren eingegangen. Der aktuelle Stand der Technik wird besprochen. Der entwickelte Algorithmus basiert auf einer speziellen Form der Wasserscheidentransformation, die markerbasierte Wasserscheidentransformation. Das Verfahren wurde mit einem Maskenbild und einer Benutzerinteraktion kombiniert. Zur Berechnung des Maskenbildes, durch welches der Algorithmus seine Robustheit erhält, wird ein spezielles Verfahren eingesetzt, dass auf der Varianz basiert. Die markerbasierte Wasserscheidentransformation und die zugehörigen Bestandteile werden ausführlich besprochen. Es werden die dafür notwendigen morphologischen Grundlagen, wie geodätische Distanztransformation, geodätische Erosion sowie Rekonstruktion durch Erosion und die Minimaauferlegungstechnik erläutert. Die als Markierungsbild entworfene Segmentierungslogik wird erklärt. Die Evaluierung des Segmentierungsalgorithmus erfolgt anhand des Vergleichs mit einer manuell durchgeführten Zellsegmentierung. Die verwendeten Bewertungskriterien werden erläutert und die erzielten Werte werden aufgezeigt. Zusätzlich wird die prinzipielle Eignung des Segmentierungsalgorithmus zur Verfolgung der Zellkonturen durch Neusegmentierung besprochen. Zu Demonstrationszwecken wurde eine Benutzeroberfläche erstellt.

Schlüsselworte
Phasenkontrast , Segmentierung , Kontur , dendritische Zellen 

Fachgebiete
Algorithmen , Bildverarbeitung , Medizintechnik 




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